反渗透技术能够去除进水中99%以上的溶解盐（离子）、颗粒物、胶体、有机物、细菌和热原（尽管不能指望反渗透系统100%去除细菌和病毒）。反渗透膜根据污染物的大小和电荷进行截留。任何分子量大于200的污染物都可能被运行正常的反渗透系统截留（相比之下，水分子的分子量为18）。同样，污染物的离子电荷越大，就越难通过反渗透膜。例如，钠离子只有一个电荷（一价），因此不像钙离子那样容易被反渗透膜截留（钙离子有两个电荷）。同样，这也是为什么反渗透系统无法很好地去除二氧化碳等气体的原因，因为这些气体在溶液中电离程度不​​高（带电荷），而且分子量很低。由于反渗透系统不去除气体，渗透水的 pH 值可能会略低于正常值，这取决于进水中的 CO2 含量，因为 CO2 会转化为碳酸。

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